子宫内膜异位症首先通过症状及体格检查初步判断，然后通过B超、腹腔镜、血清学、活检来诊断出来。腹腔镜检查是明确子宫内膜异位症的最佳方法，可能明确知道内膜异位情况，比如卵巢性内异症、腹膜型内异症，并且可以对可疑的病理组织进行活检即可明确。B超可以明确异位囊肿的大小、位置和形状也能检查出来。
诊断子宫内膜异位症的方法
诊断依赖于受累的部位,在临床检查中常可以发现异位症。通常受累的卵巢因伴有异位囊肿而增大，或子宫骶骨韧带有触痛结节，在妇科双和诊中被发现。
1、B超：B型超声检查为妇产科常用的检查方法之一，且对妇产科疾病的诊断具有重要的作用。可确定囊肿的位置、大小、形状及发现妇科检查时未触及的包块；
2、血清EMAb的检测：抗子宫内膜抗体（EMAb） 抗子宫内膜抗体是一种以子宫内膜为靶抗原，并引起一系列免疫病理反应的自身抗体，是子宫内膜异位症的标志抗体。血清EMAb的检测为子宫内膜异位症患者的诊断及疗效观察的有效检查方法；
3、X线检查：可行单独盆腔充气造影、子宫输卵管碘油造影协助诊断盆腔子宫内膜异位症；
4、肿瘤标志物：CA125(癌抗原125)可用作此种疾病的标志物,但26%的正常妇女也会表现为CA125升高,而20%患其他良性妇科疾病者CA125也升高，其敏感性和特异性都很高，因此对于子宫内膜异位症的诊断有一定的帮助，同时可以监测子宫内膜异位症的疗效；
5、腹腔镜检查：在临床疑似病例的确诊,或对于慢性盆腔疼痛和不孕妇女做出排除诊断中具有重要作用。这种侵入性的诊断工具可以通过直视对疾病进行描述和分期；
6、磁共振成像（MRI）：MRI可多平面直接成像，直观了解病变的范围、起源和侵犯的结构，可对病变进行正确的定位，对软组织的显示能力增强。因此，MRI诊断子宫内膜异位症及了解盆腔病变及粘连情况均有很大价值。
患有子宫内膜异位症如果不及时治疗，将会对生育有着极大的影响，甚至会导致不孕的发生，所以对于疾病，一定要早发现，早治疗，避免留下遗憾。
