FOXG1综合症的典型症状是：先天性躯体畸形，脑部结构性功能异常。患儿在出生时体重偏小，头部发育会比正常婴儿缓慢，在婴幼儿早期即会有小头畸形症。
FOXG1综合症
此病症可归属为一类先天性脑功能异常，即机体内联接左右脑的胼胝体发育不全或过薄，大脑皮层部位的脑回数量减少，脑内白质的数量亦比正常婴儿少。FOXG1综合症会影响机体方方面面的发育过程，此病患儿通常会有严重的智力残障，异常或自发的肢体活动，诸如：腿脚抽搐，刻板的双手活动，这些都很常见。如果没有接受相应的治疗，大多数患儿无法习得正常坐立或行走的运动机能。
FOXG1综合症有癫痫症状
FOXG1综合症患儿通常会有不同程度的进食困难，睡眠障碍，易怒，易哭，癫痫等症状。其他症状还包括：语言与社交功能障碍，具体表现为：怯于与他人眼神接触，言语功能几近丧失。鉴于有这些社交功能受损症状。FOXG1综合症亦被归类为自闭症的一种类型，其先前也被认为是遗传病Rett综合症的一种亚型，其最主要的症状亦是先天性脑功能异常，其他症状包括：生长发育障碍，智力以及言语交流障碍等。两者的差异在于，Rett综合症的病例中通常只有女性患者，而FOXG1综合症既有男性患者，又有女性患者。Rett综合症患者在婴幼儿期间，有一段表面上尚属正常的生长发育过程。但是FOXG1综合症的患者并非如此。
FOXG1综合症发病率
迄今为止，已有的医学文献中仅有100多个此病病例的确诊记录。
FOXG1综合症基因突变
FOXG1综合症，顾名思义，是由FOXG1基因发生突变而诱发的。此基因为合成G1叉头蛋白提供遗传指令编码。该蛋白质在胎儿大脑(尤其是在医学上称之为前脑胞的位置区域)发育的过程中起着重要作用，前脑胞最终发育为新生儿的一些重要的脑内组织，包括人脑的最主要部分(大脑)，大脑控制着人体的大部分生理活动，如言语，感官，学习和记忆等。
FOXG1综合症由FOXG1基因突变引起
在一些病例中，FOXG1 综合症是由FOXG1基因本身发生突变而诱发的。在另一些病例中，此遗传病是由位于14号染色体长臂区域的基因缺失而诱发的，其中包括FOXG1基因的缺失。所有这些类型的基因突变都会抑制G1叉头蛋白的合成，并会影响正常蛋白质功能的发挥。如果缺失了具有正常功能的G1叉头蛋白，会影响胎儿大脑正常的发育，会使得FOXG1综合症新生儿患者出现一些典型的症状，如结构性脑功能异常与严重的躯体异常与发育障碍。
FOXG1综合症遗传模式
FOXG1综合症遵循常染色体显性遗传模式，即每个细胞中突变的基因发生一次复制过程就足以诱发此病。所有已确诊的此病病例都是由FOXG1等基因发生缺失或突变而引发的，而患者的家庭成员往往都并没有此病的患病史。因为此病是一种危害严重的遗传病，所以所有的FOXG1综合症患者都没有后代。
