Kleefstra综合症是引发机体多脏器功能紊乱的一种疾病，其典型症状包括：发育迟缓，智力障碍，严重的言语障碍和肌张力减退等。常见的症状包括头小畸形和平头畸形。典型的面部异样特征包括：一字眉， 两眼距离过远，面瘫，上倾鼻，凸颌，嘴唇外翻，巨舌等。患者可能兼发小儿肥胖，体重明显超过同龄人。
Kleefstra综合症遗传咨询
Kleefstra综合症患者可能会并发脑部结构性异常，先天性心脏病，泌尿生殖系统疾病，并容易患严重的呼吸系统感染。在儿童时期，他们便会出现自闭症的症状和相关影响社会交往的发育障碍。到了青少年时期，他们便会对大多数事物失去兴趣，并且反应迟钝。
Kleefstra综合症发病率
Kleefstra综合症的具体发病率不可考。仅在最近，医学上可将它和其他有类似症状的疾病区分开来。
Kleefstra综合症基因突变
EHMT1基因的缺失或是突变会使该基因功能受损，从而导致Kleefstra综合症。EHMT1 基因的功能是促使常染色体甲基转移酶形成。甲基转移酶能滋养被称为组蛋白的蛋白质。组蛋白指的是与特定DNA相连的结构蛋白质，该蛋白质的功能是能使染色体成形。通过将被称为甲基的分子融入组蛋白，甲基转移酶能抑制特定基因的活动，这对于组蛋白正常的生长与功能的发挥是至关重要的。
Kleefstra综合症面部特征包含面瘫
大多数Kleefstra综合症患者，在其每个细胞的9号染色体的某个拷贝上缺失大约100万对DNA碱基。缺失发生的位置是9号染色体34区3带的长臂区域，该区域包含EHMT1基因。一些患者在此染色体区域有不同程度的遗传物质微缺失。每个细胞里的9号染色体的某一拷贝中的EHMT1基因缺失，被认为是使得有此9号染色体34区3带微缺失的患者并发Kleefstra症症状的主要原因。可是在一些患者身上，此区域其他基因的缺失亦可能会使得患者出现别的症状。
约25%的Kleefstra综合症患者体内并没有缺失9号染色体上的基因。而这些患者体内的EHMT1基因却发生了突变。这些突变能改变常染色体甲基转移酶中的各种氨基酸(组成蛋白质的基本单位)正常功能的发挥。另外一些突变能使得酶原本正常的生成过程过早地终止，或是变更基因的遗传编码指令传导路径，影响酶的合成过程。
Kleefstra综合症的9号染色体存在缺失
这些基因突变通常会使得酶失去活性，并迅速将其分解，或是使得酶的功能大大减退，无法正常发挥作用。EHMT1 基因的缺失或是突变都会使得原本发挥一定功能的常染色体甲基转移酶无法正常合成。这样会使得机体的许多器官和组织中特定基因的活动，无法得到机体的合理调控，因而就出现了Kleefstra综合症所特有的身体发育和机能异常等症状。
Kleefstra综合症遗传模式
Kleefstra综合症可归属于常染色体显性遗传模式，因为每个细胞的9号染色体的某个拷贝缺失，或是EHMT1 基因的某个拷贝出现变异，便足以使得患者出现Kleefstra综合症的症状。然而大多数情况下，Kleefstra综合症并不具有遗传性。在生殖细胞(精子或卵子)的形成过程中，或是在胎儿早期的发育过程中，基因突变是一项不可预测的随机事件。通常，患者的其他家庭成员也都没有此病的患病史。据报道，仅部分患有Kleefstra综合症的患者结婚生子。
很少情况下，患者从未患此病的父亲或母亲一方遗传而得有缺失片段的9号染色体。在这些情况下，父亲或母亲携带有已重组的染色体(或被称之为平衡易位的染色体)，在这些染色体中，并没有出现基因的增加或减少。平衡易位的染色体通常并不会使得患者出现任何健康方面的问题。然而，当该类染色体被遗传至下一代时，原本易位的平衡可能会被打破。
遗传到非平衡易位染色体的新生儿体内，会再次发生染色体重组，重组过程中会新增或减少遗传物质。遗传到非平衡易位染色体的Kleefstra综合症患者体内，在9号染色体长臂上会缺失一些遗传物质。而另一些Kleefstra综合症患者从未患该病的父亲或母亲一方遗传而得9号染色体34区3带微缺失的遗传病。而患者父亲或母亲一方体内出现的染色体嵌合现象是导致该患者体内某些遗传物质缺失的主要原因。所谓的染色体嵌合，指的是某个体体内一些细胞(包括精子或是卵子)中缺失遗传物质，但体内另一些细胞中却并不缺失该类遗传物质。
